В августе 1912 г. Хабаровская таможенная застава преобразована в таможню II класса. После революции 1917 г. Хабаровская таможня практически прекратила свою деятельность и в 1938 г. прошло окончательное расформирование таможенных структур.
Новое таможенное формирование появилось только в 1969 г., когда в Хабаровском Аэропорту был образован Хабаровский таможенный пост Владивостокской таможни, который 19.02.1976 был преобразован Хабаровскую таможню Приказом Министерства внешней торговли СССР № 69. Именно эту дату принято считать днем образования Хабаровской таможни, которой сегодня исполнилось 35 лет.
Регион деятельности Хабаровской таможни включает в себя: 9 районов Хабаровского края (Аяно-Майский, Бикинский, Верхнебуреинский, Вяземский, им. Лазо, Нанайский, им. Полины Осипенко, Тугуро-Чумиканский, Хабаровский), города краевого подчинения Бикин и Хабаровск, а также акваторию вод территориального моря РФ, омывающего берега указанных административных образований.
Регион деятельности определил особое место Хабаровской таможни в Дальневосточном таможенном управлении, как единственной на Дальнем Востоке таможни, которая осуществляет контроль в отношении товаров, перемещаемых через границу всеми видами транспорта: речным, морским, автомобильным, железнодорожным и воздушным.
На деятельность таможни значительным образом повлияло активное развитие внешнеэкономической деятельности в 90-х гг. К примеру, в 1998 году было оформлено 8 846 ГТД, в 2000 – 9562 ГТД, в 2005 – 14909 ГТД. За прошедшие десять лет в Хабаровской таможне оформлено боле 130 тысяч ГТД, свыше 23,6 миллионов тонн различных товаров. Возросло число участников внешнеэкономической деятельности, увеличился объем перемещаемых товаров. Сейчас в регионе деятельности таможни экспортно-импортные операции осуществляют более 500 участников ВЭД.
Пожалуй, самой целью существования таможни надо считать пополнение государственной казны. В 1994 году хабаровские таможенники перечислили в федеральный бюджет 117 млрд. рублей, а в 1997 (до деноминации) уже 195 млрд. рублей. Несмотря на то, что в 1998 произошел обвал курса рубля, и поток импортных товаров был резко сокращен, хабаровским таможенникам удалось собрать 280 млн. рублей. В 1999 собрано 555 млн. рублей. В 2000 году Хабаровская таможня преодолела рубеж в 1 миллиард рублей.
На протяжении следующих 7 лет суммы таможенных платежей, перечисленных в федеральный бюджет, увеличивались: 2001 год – 1,3 млрд., 2002 – 2,3 млрд., 2003 – 3,3 млрд., 2005 – 6,1 млрд. Максимальную сумму платежей за год Хабаровским таможенникам удалось собрать в 2007 году – 6,4 млрд. рублей. В 2008 и 2009 году вследствие экономического кризиса объем перечисляемых платежей значительно снизился, тем не менее, за 2009 год Хабаровская таможня перечислила в бюджет 3,4 млрд. рублей. В 2010 году сумма перечислений превысила 4,2 млрд. рублей.
Большое внимание уделяется правоохранительной деятельности. За последние 10 лет в Хабаровской таможне возбуждено 2610 дел об административных правонарушениях, 323 уголовных дела, из них 132 дела по контрабанде лесоматериалов и 24 уголовных дела по линии борьбы с контрабандой наркотиков. Положительные результаты в обнаружении наркотических средств дает отлаженное взаимодействие оперативников с кинологическим отделом таможни.
Недекларирование валюты – одно из самых распространенных правонарушений, допускаемых физическими лицами. Хабаровские таможенники неоднократно сталкивались с попытками незаконного перемещения редких предметов. К примеру, в 2005 году был пресечен вывоз из России советских банкнот датированных 1917 – 1922 годом. В 2005 и в 2008 были задержаны монеты, отнесенные к категории «культурных ценностей» 1814, 1816, 1817 года выпуска. Была предотвращена попытка вывоза в Японию фарфоровой посуды, изготовленной более 100 лет назад.
Еще одной интересной культурной ценностью, вывоз которой удалось предотвратить, была книга «История государства Российского» изданная в 1889 году. Пожалуй, самым необычным предметом правонарушения был фрагмент метеорита, изъятый в 2007 году. В истории Хабаровской таможни есть беспрецедентный случай обнаружения крупнейшей партии (более 800 килограммов) таблеток эфедрина.
В настоящее время работа таможни акцентирована на выполнение перспективных направлений деятельности таможенных органов Российской Федерации, определенных Президентом, Правительством Российской Федерации и Федеральной таможенной службой. Расширяется практика применения электронного декларирования. Приказом ФТС России от 05.10.2010 № 1820 создан Приамурский таможенный пост (центр электронного декларирования).
Продолжается реализация Концепции таможенного оформления и таможенного контроля товаров в местах, приближенных к государственной границе Российской Федерации. В рамках Концепции, одной из ступеней развития таможни, может стать реализация проекта создания постоянного грузо – пассажирского пункта пропуска Хабаровск (о. Большой Уссурийский) – Фуюань на российской – китайской границе.
